MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013851	CGC	2	6	2484466	2484471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_013851	GCG	2	6	2484510	2484515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_013851	CCCGC	2	10	2484571	2484580	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4504	NC_013851	ATC	2	6	2493941	2493946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013851	ATC	2	6	2494589	2494594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013851	CGG	2	6	2494617	2494622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_013851	GCC	2	6	2494635	2494640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_013851	TC	3	6	2494649	2494654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_013851	CGA	2	6	2494692	2494697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_013851	TTCG	2	8	2494796	2494803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_013851	ACG	2	6	2494860	2494865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_013851	C	6	6	2496926	2496931	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4513	NC_013851	GCC	2	6	2496933	2496938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_013851	GCC	2	6	2496996	2497001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_013851	CG	3	6	2497007	2497012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_013851	ATACC	2	10	2497573	2497582	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4517	NC_013851	CG	4	8	2498758	2498765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_013851	GC	3	6	2500189	2500194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_013851	GC	3	6	2500224	2500229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_013851	CGCGC	2	10	2500263	2500272	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4521	NC_013851	GCC	2	6	2500275	2500280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_013851	AAT	2	6	2500293	2500298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_013851	GGCGC	2	10	2503775	2503784	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4524	NC_013851	CCACTC	2	12	2507287	2507298	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_013851	ATG	2	6	2508082	2508087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013851	CGA	3	9	2508102	2508110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_013851	TGG	2	6	2511310	2511315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013851	CA	3	6	2511401	2511406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_013851	GCG	2	6	2512033	2512038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_013851	GTC	2	6	2512041	2512046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_013851	GCC	2	6	2512066	2512071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_013851	CA	4	8	2513908	2513915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_013851	ATT	2	6	2514452	2514457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013851	GCCAC	2	10	2514466	2514475	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4535	NC_013851	CG	3	6	2514490	2514495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_013851	AAG	2	6	2514499	2514504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_013851	GGC	2	6	2514506	2514511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_013851	GATC	2	8	2514550	2514557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_013851	AGG	2	6	2514558	2514563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_013851	TTGGGC	2	12	2514566	2514577	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4541	NC_013851	GCC	2	6	2514611	2514616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_013851	GCCAC	2	10	2514645	2514654	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4543	NC_013851	TCGA	2	8	2514696	2514703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_013851	TTG	2	6	2514765	2514770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013851	GCC	2	6	2514810	2514815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_013851	CGC	2	6	2514841	2514846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_013851	GCG	2	6	2514854	2514859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_013851	GTA	2	6	2514878	2514883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_013851	GGT	2	6	2514899	2514904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013851	GCCTGA	2	12	2514909	2514920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_013851	TCC	2	6	2514989	2514994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_013851	ATCT	2	8	2515121	2515128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_013851	TCT	2	6	2515135	2515140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_013851	AGCCC	2	10	2515183	2515192	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4555	NC_013851	GTC	2	6	2516879	2516884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_013851	GTC	2	6	2516921	2516926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_013851	CGG	2	6	2516961	2516966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_013851	GCA	2	6	2516974	2516979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_013851	GCGG	2	8	2517001	2517008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_013851	AGCG	2	8	2517036	2517043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_013851	CGC	2	6	2517046	2517051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_013851	CG	3	6	2517085	2517090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_013851	CTC	2	6	2517143	2517148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_013851	TCC	2	6	2517174	2517179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_013851	TCG	3	9	2517183	2517191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_013851	CGC	2	6	2517301	2517306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_013851	TCG	2	6	2517336	2517341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_013851	GCG	2	6	2517359	2517364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_013851	CAT	2	6	2517374	2517379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_013851	GTA	2	6	2517413	2517418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_013851	CGG	2	6	2517431	2517436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_013851	CGT	2	6	2517499	2517504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_013851	CCG	2	6	2517599	2517604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_013851	TTC	2	6	2517651	2517656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_013851	CTC	2	6	2517686	2517691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_013851	CTC	2	6	2517701	2517706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_013851	CGT	2	6	2517718	2517723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_013851	CGG	2	6	2517727	2517732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_013851	CGG	2	6	2517734	2517739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_013851	CGG	2	6	2517741	2517746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_013851	CTCGCG	2	12	2517789	2517800	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_013851	GGC	2	6	2517803	2517808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_013851	GCT	2	6	2517809	2517814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_013851	GCG	2	6	2517830	2517835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_013851	TCA	2	6	2517866	2517871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_013851	AGC	3	9	2517889	2517897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_013851	TCA	2	6	2517904	2517909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_013851	CTC	2	6	2517921	2517926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_013851	GAT	2	6	2517966	2517971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013851	GAA	2	6	2518014	2518019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_013851	TGT	2	6	2518022	2518027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_013851	TCC	2	6	2518078	2518083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_013851	TGA	2	6	2518112	2518117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013851	CGA	2	6	2518169	2518174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_013851	GTA	2	6	2518200	2518205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_013851	GGA	2	6	2518221	2518226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013851	ATC	2	6	2518237	2518242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_013851	TGA	2	6	2518253	2518258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013851	GGC	2	6	2518307	2518312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_013851	TGA	2	6	2518367	2518372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_013851	GTG	2	6	2521631	2521636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013851	AG	3	6	2521682	2521687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013851	GACAG	2	10	2521761	2521770	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4604	NC_013851	GCG	2	6	2521844	2521849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013851	AAC	2	6	2521881	2521886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_013851	CATG	2	8	2522192	2522199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_013851	TCG	2	6	2522263	2522268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_013851	CGC	3	9	2522541	2522549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_013851	GCG	2	6	2522550	2522555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_013851	GAGC	2	8	2522583	2522590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_013851	CG	3	6	2523998	2524003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_013851	TCCC	2	8	2524012	2524019	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4613	NC_013851	CGGC	2	8	2527552	2527559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_013851	CGT	2	6	2527628	2527633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_013851	GAGG	2	8	2530012	2530019	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013851	CGG	2	6	2530029	2530034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_013851	GTC	2	6	2530061	2530066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_013851	CCG	2	6	2530101	2530106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_013851	ACCCG	2	10	2530109	2530118	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4620	NC_013851	CAC	2	6	2530127	2530132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_013851	GACC	2	8	2530144	2530151	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_013851	CG	3	6	2531164	2531169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_013851	CGG	2	6	2532557	2532562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_013851	CG	3	6	2532574	2532579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_013851	TC	3	6	2532656	2532661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_013851	AG	4	8	2534274	2534281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013851	AGG	2	6	2535609	2535614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013851	CAC	2	6	2535627	2535632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_013851	CTC	2	6	2535860	2535865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_013851	GCC	2	6	2535904	2535909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_013851	TTA	2	6	2535927	2535932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_013851	GGT	2	6	2535964	2535969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_013851	CCG	2	6	2535995	2536000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4634	NC_013851	CGA	2	6	2536012	2536017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_013851	GTA	2	6	2536034	2536039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_013851	CGA	2	6	2536087	2536092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4637	NC_013851	TCGTC	2	10	2538978	2538987	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4638	NC_013851	GT	3	6	2538997	2539002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4639	NC_013851	TC	4	8	2543359	2543366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4640	NC_013851	TCG	2	6	2543386	2543391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4643	NC_013851	CGG	3	9	2545192	2545200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4644	NC_013851	GTCG	2	8	2545225	2545232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4645	NC_013851	GC	3	6	2545285	2545290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4652	NC_013851	CGA	2	6	2546618	2546623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4662	NC_013851	TA	3	6	2559560	2559565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4663	NC_013851	TCG	2	6	2559621	2559626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4664	NC_013851	CGC	2	6	2563193	2563198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4756	NC_013851	TCC	2	6	2612110	2612115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4757	NC_013851	CG	3	6	2612160	2612165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4758	NC_013851	CGGC	2	8	2612169	2612176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4762	NC_013851	GCG	2	6	2614524	2614529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4764	NC_013851	CGG	2	6	2614782	2614787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4893	NC_013851	CGC	3	9	2697410	2697418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4894	NC_013851	TGG	2	6	2698926	2698931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4896	NC_013851	GCG	2	6	2699017	2699022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4897	NC_013851	GCT	2	6	2699172	2699177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4898	NC_013851	GC	3	6	2700597	2700602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4923	NC_013851	CTG	3	9	2712561	2712569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4927	NC_013851	CGC	2	6	2712705	2712710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4958	NC_013851	CG	3	6	2729699	2729704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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